中国疾控中心慢病中心于2005年12月被世界卫生组织批准成为“世界卫生组织慢性非传染性疾病社区综合防治合作中心”。该合作中心的任务是与世界卫生组织紧密合作，开展以社区为基础的慢病干预项目，促进适宜干预措施的开发和应用，加强慢病防治相关政策与指南的制订，提高中国以及西太地区的慢性病防治能力。2010年3月，该合作中心成功续任，新的任期是2010年3月30日至2014年3月30日。新任期内，合作中心的工作计划主要包括：
l 实施以社区为基础的慢性病干预项目，支持区域的慢性病防控能力建设
l 开展慢性病防控学术交流会，增进中国与区域内各国的相关能力建设
l 开展包括减少中国人群食盐摄入在内的高血压干预方面的项目，
l 监测慢性病和相关危险因素的流行状况，开发流行病学预测模型
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